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一、穴盘育苗
第一阶段：胚根萌发至子叶出现
温度以15℃至18℃为宜，高于18℃将抑制种子的萌芽。播种后需覆盖粗蛭石，有利于保持介质湿润，同时要将种子适当遮阴，避免阳光直射。基质中保持较低的可溶性盐含量，pH值控制在5.2至6.2之间。
第二阶段：子叶生长至第一对真叶出现
温度仍保持在15℃至18℃，土壤湿度要相对降低，但穴盘不能太干燥。不能使可溶性盐含量增加，EC值保持在0.5左右。可施可溶性氮肥，浓度以50ppm为适。第一、二阶段大概需14至21天。
第三阶段：真叶生长及发育阶段
将温度维持在12℃至16℃，施14－0－14或12－2－14的肥料，浓度增加到100ppm，约每周一次。应适当控制水分，两次浇水间让基质有个干透的过程，形成干湿循环，但要以植株的叶片不出现萎蔫现象为基准。
第四阶段：炼苗阶段根系已形成，温度、湿度及施肥浓度大致与第三阶段相同。此阶段大概需要7天时间。炼苗后应及时上盆。
二、栽培管理
1.移植上盆当幼苗长出3至4片真叶时可移植上盆，此时幼苗根系发达，生长旺盛。花盆直径以10至13厘米为宜。栽培基质需透水性好，pH值为5.5至6.2。移植可选择傍晚或阴天，以提高成活率。
2.温度生长适温为10℃至15℃。温度高于15℃会引起徒长。冬季在无霜的条件下，将温度保持在2℃至5℃。若放在室外时需要有覆盖物。一月份植株开始在8℃至10℃的温度条件下生长。在温度过高或过低的情况下红色系、紫色系、蓝色系的三色堇在色泽上都会产生一些变化，而黄色系则相对稳定，较少发生变化。例如：日温高于25℃时，红色花最容易变浅；在温度过低时紫色系、蓝色系的品种颜色会变深。
3.光照三色堇为中日照植物。植株在生长期和开花期需要有充足的光照，利于植株的分枝和生长。在7至9月要进行遮阴，避免强日照直射。光照不足，将导致植株细弱且易徒长，而适当补充光照则会相对缩短栽培时间。
4.水肥管理栽培过程中应遵循“宁干勿湿”的原则，过湿容易造成茎部腐烂，多病害，但过干也易造成植株萎蔫。三色堇需肥量不高，根系对基质中的高浓度可溶性盐敏感。种植者可根据植株的生长情况，交替施用20－8－20和14－0－14的肥料。高温季节为了防止出现缺硼症状，应施用硼砂。冬季肥水过多，特别是尿素过多时，易引起僵苗。
5.病虫害基质过湿且pH值高于6.2易导致根串珠霉菌的产生，这种病害会使三色堇根系发黑，根毛受损，且叶片出现黄色。此时应避免重复使用穴盘及把植株放置在受污染的土壤中，这样病害会加快传播。可用土菌灵＋甲基托布津灌根。
如果三色堇叶部有灰色、黑色、蓝色、粟红色的斑点病，则表明植株缺肥或生长条件不适（如高湿）。应在天黑前使叶片干燥，可最大限度降低叶部病害。定期施肥可保持植株健壮，减少病害发生几率。
高温易引起生长点发黄，而非缺硼。若缺硼，则生长点仍是绿色。室外栽培三色堇，要防止雨水过多，否则腐霉菌、丝核菌引起的病害会周期性发作。应注意用药剂灌根。
虫害有夜蛾和蚜虫等。
6.注意事项
（1）避免将植物的根系植入土中太深。
（2）三色堇是很好的土壤高pH值指示品种，当pH值超过6.5将会出现问题。
（3）在冬天，较高的相对湿度和叶面湿度可能导致灰霉菌的产生。
（4）防止植株缺硼。缺硼会导致新叶变厚，皱缩成杯状，但叶色仍为绿色，同时生长点坏死并在分生组织下形成许多小分枝。在整个生长过程中施硼肥1至2次，特别是在高温穴29℃雪条件下。施用硼砂的浓度为40ppm，施用前应先用热水溶解。
（5）通过调节湿度、pH值及施用杀真菌剂，可控制根腐病的发生。
